压缩空气在螺杆空气压缩机内部的中间冷却器与后冷却器中冷却的越多，压缩机就越节能，水蒸气就会冷凝得越多。螺杆空气压缩机安装对压缩机室内的通风系统要求不高，因为冷却水中包含的热大约占电动机能量的90%。压缩机水冷却系统，可以基于三个主要原则之一：

1、无循环水的开放系统（连接到外部的水供应）

2、带循环水的开放系统（冷却塔）

3、带循环水的封闭系统（包括外部换热器系统/散热器）

在带循环水的开放系统中，来自压缩机的冷却水在开放的冷却塔中被再次冷却，但水会逐渐被周围空气污染。可溶性盐类沉积在热的金属表面，降低冷却塔的热传递能力。水必须定期利用化学品避免藻类的生长。冬季当压缩机不工作时，冷却塔必须要排水或者水必须被加热以防止冻结。

在一个封闭的冷却系统中，同样的水连续不断的在压缩机和一些外部换热器之间循环。这样，换热器可以通过外部的水循环或者通过周围的空气来进行冷却。当水被另一个冷却水回路冷却时，则使用平面板式换热器。

当水被周围的空气冷却时，则使用含有管道与散热片的冷却矩阵。一个或多个风扇会强制周围的空气通过管道和散热片。如果冷却水有限，这种方法是合适的。开放式或封闭式循环的冷却能力大约是相同的，即压缩机冷却水要比冷却液温度高5℃。如果冷却水是由周围的空气冷却，则需要添加防冻剂（如乙二醇）。封闭冷却水系统里是纯净的软化水。添加乙二醇时，螺杆空气压缩机的水流量必须重新计算，因为乙二醇的类型和浓度会影响水的比热和粘度。

同样重要的是，在第一次填充该系统时，必须彻底清洗整个系统。正确实施的封闭水系统只需要很少的监督，维护费用也很低。对于安装存在潜在腐蚀性的现有冷却水，需要在冷却器中设计有防腐蚀材料，如耐热铬镍铁合金。